Než se pustíte do práce, bezpečnost je na prvním místě. Digestoř vždy vypněte, odpojte ji z elektrické zásuvky a ujistěte se, že je zcela vychladlá. Srdcem každé digestoře jsou filtry, kde se usazuje nejvíce mastnoty. Pokud máte kovové filtry, opatrně je vyjměte a ponořte na 10 až 20 minut do dřezu s horkou vodou a lžící jedlé sody. Mastnota krásně povolí a filtry pak stačí dočistit jemným kartáčkem nebo houbičkou. Skvělým trikem je také nechat pod zapnutou digestoří vařit velký hrnec s vodou. Horká pára pomůže mastnotu uvolnit ještě před samotným čištěním. Naopak uhlíkové filtry se nečistí, ale je potřeba je pravidelně měnit, obvykle každých 6 až 12 měsíců, podle doporučení výrobce.